Το Ειδικό Λύκειο Ιλίου, όπως και το Ειδικό Γυμνάσιο Ιλίου, ιδρύθηκε το 1980 με τα Προεδρικά Διατάγματα  825 και 826 αντίστοιχα, (ΦΕΚ 204-6/9/1980). Στην αρχή στεγάστηκε ως παράρτημα της ΕΛΕΠΑΠ στο Παγκράτι. Το 1983 με την υπουργική απόφαση περί «μεταφοράς της έδρας Δημοσίου Ειδικού Γυμνασίου και Λυκείου Αθήνας» (ΦΕΚ 553- 22/9/1983 ) έγινε η μετεγκατάσταση της στην περιφέρεια του Γραφείου Μέσης Γενικής Εκπαίδευσης της Δυτικής Αττικής, στο χώρο του Εθνικού Ιδρύματος Αποκατάστασης Αναπήρων (Ε.Ι.Α.Α) στο Ίλιον,  όπου βρίσκεται μέχρι και σήμερα.

 

Το Ειδικό Λύκειο Ιλίου αποτελεί δομή δευτεροβάθμιας εκπαίδευσης για μαθητές με κινητικές αναπηρίες. Πρόκειται για εκπαιδευτική  μονάδα που ανήκει στο δήμο Ιλίου και φιλοξενείται στο χώρο του Ε.Ι.Α.Α.

            

Στεγάζεται σε ένα διώροφο κτίριο του Ε.Ι.Α.Α. Το κτίριο είναι ιστορικής σημασίας, καθώς χτίστηκε τη δεκαετία του 1930 και αποτελεί εξαιρετικό δείγμα της αρχιτεκτονικής της εποχής εκείνης. 

 

Το Ειδικό Λύκειο στεγάζεται στο ισόγειο του κτιρίου με ξεχωριστή είσοδο, προσβάσιμη, στη πίσω πλευρά του κτιρίου. Το ειδικό γυμνάσιο στεγάζεται στον πρώτο όροφο. Λόγω της υψομετρικής διαφοράς του εδάφους η είσοδος του σχολείου είναι στο επίπεδο του δρόμου, χωρίς να υπάρχουν σκαλοπάτια ώστε να μπορούν εισέρχονται οι μαθητές με τα αμαξίδια. Οι δύο όροφοι επικοινωνούν με ασανσέρ καθώς και με κεντρική σκάλα